505보안부대는 1971년부터 광주 서구 쌍촌동에 주둔했다. 505보안부대는 1980년 5월의 처음과 끝을 기획ㆍ관리ㆍ통괄한 기관이라고 할 수 있다. 대학생이 도심으로 진출하기 이전인 5월 14일 오전 10시 45분부터 11시 20분까지 전라남도 도지사실에서는 민관합동의 “학원사태 수습대책협의회”가 열렸다. 참석자들은 전남대와 조선대 총장과 중앙정보부 전남지부장, 광주ㆍ전남 합수단장(505보안부대장), 전남도경찰국장 등 이었다. 같은 날 오후에 열린 ‘지역 계엄군 지휘관 작전회의’에는 505보안부대 대장과 제31사단장, 제7공수여단장 등이 참석했다.

 5월 17일 자정에 ‘포고령 제10호’가 발령되기 이전에 군ㆍ검ㆍ경 합동수사본부 수사관들은 예비검속 대상자 연행 작전을 시작했다. 505보안부대는 차량 22대와 86명을 동원하여 학생회 간부와 재야인사 등 22명을 추적했고, 정동년 등 12명을 연행했다. 505보안부대는 이들에 대한 강압적이고 고문을 병행한 조사를 통해 이른바 “김대중 내란음모사건”을 조작했다.

 5·18민중항쟁이 본격화되자, 505보안부대는 정보 수집을 위해 도심에 요원들을 파견했다. 요원들은 시위와 진압 상황들을 정리하여 수시로 보고했다. 이들이 작성한 보고서는 보안사령부로 전송되었고, 진압작전 수립의 기본 자료로 활용되었다. 5월 19일에는 광주 출신의 보안사령부 홍석률 대령이 내려와 505보안부대원들을 만나고, 정보를 수집했다. 한편 계엄군은 광주 도심에서 사복을 입고 첩보를 수집하는 편의대(便衣隊)를 운용했다.

 505보안부대의 활약은 여기에서 그치지 않았다. 5·18민중항쟁과 그 이후에 연행한 주요 인물들에 대한 조사를 주관했다. 조사 과정은 폭력과 고문 그 자체였다. 또 다른 주요 업무는 5·18민중항쟁 관련 사망자의 사인을 확정하는 것이었다. 시신 검안은 5월 29일까지 130구, 5월 30일 12구 등 총 142명에 대해 이루어졌다. 검안 의사들이 사망진단서를 작성했고, 이를 바탕으로 검찰은 검시보고서를 작성했다. 그런데 정부가 ‘폭도들에게는 보상하지 않는다’는 원칙을 세우면서 재분류가 요구되었다. 핵심은 ‘폭도’와 ‘비폭도’의 분류였다. 또한 505보안부대는 1983년에 추진되었던 5ㆍ18구묘지 이장, 이른바 ‘비둘기 시행계획’을 주관했다.

 505보안부대는 2005년 11월에 이전했다. 광주광역시는 505보안부대 옛터가 지닌 의미와 현장성을 보전하기 위해 2007년 6월 27일 사적지 26호로 지정ㆍ고시했다.